GI |
237784360  |
Accession |
FJ411087 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Perenniporia ; Perenniporia medulla-panis
|
Sequence |
ATGAAAATCTTCAACCTACAAACCTTTGCGGGCTTTTATTGTAGGCTTGGATCTTGGAGACTTTGCCGGTCTGTGTTGATGGGTCGGCTTCTCTTAAATGCATTAGCTTATGTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAACTGTCTACGCCGTGGTCGTGAAGCACTTGATGAGCTTCGAATGGTCTTGAATGAGACATTATTGACATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-33 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATG-AAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGT----TTGTAGGCTTGGA-CTTGGAGGC-TTGTCGGTC--CCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAA-TGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ...-.((..(((((((((((((((((....)))))----))))))).)))))-.))(((((.-..(((((..--(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((..-.))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAAATCTTCAACCTACAAACCT-TTGCGGGCTTTTATTGTAGGCTTGGATCTTGGAGACTTTGCCGGTCTGTGTTGATGGGTCGGCTTCTCTTAAATGCATTAGCTTATGTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAACTGTCTACGCCGTGGTCGTGAAGCA---CTTGATGAGCTTCGAATGGTCTTG--AATGAGACA---TTATTGACATCTGA .....((..(((((((((((((.((-.....)).)....))))))).)))))..))(((((....(((((....(.(....).)))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-.(((((((((....))).)))))).)))))....)))---...)))))))).......(((((.--...))))).---.............. CBCs: ____________________________________________________________(_____________________________)___________________(_________________________________________________________________)______________________________________________ HCBCs: ______________(________(________)____________)____________________(_______(_(____)_)___)_________________________(___(________(_((__________________________)))________)_______)_________________(______)______________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 89.474 II: 92.308 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 380
End: 592 |