| GI |
237784362  |
| Accession |
FJ411089 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Perenniporia ; Perenniporia sp. MUCL 47876
|
| Sequence |
ATGGAATCTTCAACCTACAAACCTTTGCGGGTTTTTATTGTAGGCTTGGACCTTGGAGACTTTGCCGGTCTGTGTTGATGGGTCGGCTTCTCTTAAATGCATTAGCTTATGTCCTTGCGGATCGGCTCCCGGTGTGATAACTGTCTACGCCGTGGCCGTGAAGCACTTGATGAGCTTCTAACGGTCTTGAATGAGACATTATTGACATCTGG |
| Structure |
....((..(((((((((((((.(((...))).)....))))))).)))))..))(((((....(((((....(.(....).)))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((....))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......(((((....)))))............... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-37.9 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGT----TTGTAGGCTTGGA-CTTGGAGGC-TTGTCGGTC--CCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAA-TGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))----))))))).)))))-.))(((((.-..(((((..--(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((..-.))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))..................
Query: ATGGAATCTTCAACCTACAAACCT-TTGCGGGTTTTTATTGTAGGCTTGGACCTTGGAGACTTTGCCGGTCTGTGTTGATGGGTCGGCTTCTCTTAAATGCATTAGCTTATGTCCTTGCGGATCGGCTC-CCGGTGTGATAACTGTCTACGCCGTGGCCGTGAAGCA---CTTGATGAGCTTCTAACGGTCTTG--AATGAGACA---TTATTGACATCTGG
....((..(((((((((((((.((-.....)).)....))))))).)))))..))(((((....(((((....(.(....).)))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-.(((((((((....))).)))))).)))))....)))---...)))))))).......(((((.--...))))).---..............
CBCs: ___________________________________________________________(_____________________________)___________________(_________________________________________________________________)______________________________________________
HCBCs: _____________(________(________)____________)____________________(_______(_(____)_)___)_________________________(___(__________((__________________________))_________)_______)_________________(______)______________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 89.474
II: 92.308
III: 92.593
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 380
End: 591
|
