| GI |
238805209  |
| Accession |
FN393128 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-5.1 kcal/mol |
| Model |
474144 |
| Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTT--ACAGA-CCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTTNGAGGCTTGTCG-GCCATGTTTTGGT-CGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGATTCCTTGCGG-ATCGGCT---CTCGGTGTGATAAT-GTCTA--CGNCGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTTGTGAGACAGCTTTA--------------------------------------
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Query: GAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTTGA
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CBCs: __________(_(_______(_______________)______)_)________(_(___________________________)_)________________(_______________(__________(_____________________)______)______________)____________(__(______)__)______________________________________________
HCBCs: ________((____(______(__(________)_)____)_____))_____________(____(_________)____)______________________________(__________(________(_(___________)___)_____)________)____________________(______________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 75
II: 80
III: 86.364
IV: 80
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 283
End: 35
|
