GI |
11830848  |
Accession |
AJ132939 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Polyporus ; Polyporus tricholoma
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAACCTAACAAGTTTGTAACGAGCTTGCTTAGGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCTGGCTGCTCGTTCAGTCCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTCTGCGGATCGGCTCACGGTGTGATAATTGTCTACGCCGCGACCGTTGAAGCGTTTATAGGCCAGCTTCTAATCGTCTCTTGCGAGACAATTCTATCGAACTCTGA |
Structure |
.........(((((((((((((((((...)))))))).))))).))))....(((((....((((((((......)))).)))).)))))..........((((.((((..(.(((...((((.((.(((((((((....))).)))))).)))))..)..)))...)..)))))))).......(((((....))))).................. |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-56.8 kcal/mol |
Model |
33325303 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAACCTAACAAGTTTGTAACGAGCTTGCTTAGGYTTGGACTTGGAGGCTTTGCCGGCTGCCTAGTACAGT-CGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCT-TGCGGATCGGCTCACGGTGTGATAATTGTCTACGCCGCGACCG-TGAAGCGTTTATTGGCCAGCTTCTAATCGTCTCTTGCGAGACAATACTATCGAACTCT-- .........(((.(((((((((((((...)))))))).)))))..)))....(((((....((((((((.......))))-)))).)))))..........((((.((((...-(((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))-....)))......)))))))).......(((((....)))))................-- Query: GTGAAATTCTCAACCTAACAAGTTTGTAACGAGCTTGCTTAGGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCTGGCTG-CTCGTTCAGTCCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTCTGCGGATCGGCTCACGGTGTGATAATTGTCTACGCCGCGACCGTTGAAGCGTTTATAGGCCAGCTTCTAATCGTCTCTTGCGAGACAATTCTATCGAACTCTGA .........(((.(((((((((((((...)))))))).)))))..)))....(((((....((((((((-......)))).)))).)))))..........((((.((((....(((....(((.((.(((((((((....))).)))))).))))).....)))......)))))))).......(((((....))))).................. CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________(__________________)_______________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 364
End: 580 |