GI |
11830849  |
Accession |
AJ132940 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Polyporus ; Polyporus tricholoma
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAACCTAACAATTTGTAACGAGCTTGCTTAGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCTGGCTGCTCGTTCAGTCCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTCTGCGGATCGGCTCACGGTGTGATAATTGTCTACGCCGCGACCGTTGAAGCGTTTATAGGCCAGCTTCTAATCGTCTCTTGCGAGACAATTCTATCGAACTCT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-42.7 kcal/mol |
Model |
33325303 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAACCTAACAAGTTTGTAACGAGCTTGCTTAGGYTTGGACTTGGAGGCTTTGCCGGCTGCCTAGTACAGT-CGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCT-TGCGGATCGGCTCACGGTGTGATAATTGTCTACGCCGCGACCG-TGAAGCGTTTATTGGCCAGCTTCTAATCGTCTCTTGCGAGACAATACTATCGAACTCT .........(((.(((((((((((((...)))))))).)))))..)))....(((((....((((((((.......))))-)))).)))))..........((((.((((...-(((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))-....)))......)))))))).......(((((....)))))................ Query: GTGAAATTCTCAACCTAACAA-TTTGTAACGAGCTTGCTTA-GCTTGGACTTGGAGGTCTTGCTGGCTG-CTCGTTCAGTCCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTCTGCGGATCGGCTCACGGTGTGATAATTGTCTACGCCGCGACCGTTGAAGCGTTTATAGGCCAGCTTCTAATCGTCTCTTGCGAGACAATTCTATCGAACTCT .........(((.(.((((((-((((...)))).))).)))-)..)))....(((((....((((((((-......)))).)))).)))))..........((((.((((....(((....(((.((.(((((((((....))).)))))).))))).....)))......)))))))).......(((((....)))))................ CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________(__________________)_____________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 87.5 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 364
End: 576 |