GI |
257479981  |
Accession |
FJ655464 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma australe
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-50.3 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT--CTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCT-- ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((.--((....)).))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....)))---...)))))))).......(((((......)))))................-- CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________((___(_(__(______)__)_)___))___________________________________________________________(__________________________________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 92.308 III: 96.296 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 374
End: 579 |