GI |
17426685  |
Accession |
AJ301984 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; mitosporic Glomerellaceae ; Colletotrichum ; Colletotrichum coccodes
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCCCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTCGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAAACTTTTACAGGTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-45.6 kcal/mol |
Model |
150035450 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTAAACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGATTCTAGCCGTAAAACCCCC--AATTTTTTAAGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((......))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((..((...-..))....))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(--(((((....)))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCCCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTC-GACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAAACTTTTACAGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((...-..))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((..((......))....))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(..(((((....)))))). CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________________________________________________________________________(________________________________________)_______________________________(________)____ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 711
End: 876 |