| GI |
2612842  |
| Accession |
U63473 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Trichaptum ; Trichaptum biforme
|
| Sequence |
ATGTTAATATCAACTCTGATGGTTTTTGTTAACCATTGGATGTTGGACTTGGAGGTTCGTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGGACCTGTGCGCGTTTGCTAGCGGTGTAATACATTTTACTCACCACGGGCCGTGTCACTATTAGGGTCTGCTTCTAATCGTCCTTACCGGACAATATAAACTTTATGACTCTGA |
| Structure |
.........(((((((((((((((......)))))))))).)))))....(((((...(.(((((((....))))))))))))).....(((((((..((((((((((((((...(((..(((((.(.((.....)).)))))..)))))))).))).....)))))))...))))).).).....(((((.((...(....))))..)))). |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-38.3 kcal/mol |
| Model |
21629934 |
| Alignment |
Sbjct: ATGTTAATATCAACCCCGACGGTTT---TTAACTATTGGGTGTTGGACTTGGAGGATAGTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTTGGACCTGTGCGCGTTTGCTAGCGGTGTAATACATTTTATTCACCACGGGCCGTGTCACTATTAGGGTCTGCTTCTAATCG-CCTCA-CGGACAAT---AACTTTATGACTCTGACCT
.........((((((((((.((((.---..)))).))))).)))))....((((((....(((((((....))))))))))))).....(((((((...((((((((((((((...(((...((((.((((.....))))))))...))))))).))).....)))))))...))))).)-)....-((((..((---(....)))...))))....
Query: ATGTTAATATCAACTCTGATGGTTTTTGTTAACCATTGGATGTTGGACTTGGAGGTTCGTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGC-TTGGACCTGTGCGCGTTTGCTAGCGGTGTAATACATTTTACTCACCACGGGCCGTGTCACTATTAGGGTCTGCTTCTAATCGTCCTTACCGGACAATATAAACTTTATGACTCTGA---
.........((((((((((.((((......)))).))))).)))))....(((((.....(((((((....))))))).))))).....(((((((.-.((((((((((((((...(((...((((.(.((.....)).)))))...))))))).))).....)))))))...))))).).).....((((..((...(....)))...)))).---
CBCs: ______________(________________________)_________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ________________(___(____________)___)___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 92.308
III: 96.875
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 2172
End: 2384
|
