GI |
2612844  |
Accession |
U63472 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Trichaptum ; Trichaptum fusco-violaceum
|
Sequence |
ATGTTAATATCAACCCCGTCGGTTTGTAAATCAGACCGTTGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTGCTCGCAATGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGATCACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACAAATATAACCTTTGACTCT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-33.8 kcal/mol |
Model |
21629936 |
Alignment |
Sbjct: ATGTTAATATCAACCCCGTCGGTTTGTTAATCAGACCG-TGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGTATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTGCTCGCGGTGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGTACACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACAAACATAACCTTTGACTCTGACC .........(((((((((.(((((((.....)))))))-)))).)))))....(((((.....(((((((....))))))).))))).((..((...(((..(((((((.((((((.((((((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))).....))))))))))....))..)).(((((((((.......))))..))))).. Query: ATGTTAATATCAACCCCGTCGGTTTGTAAATCAGACCGTTGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTGCTCGCAATGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGATCACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACAAATATAACCTTTGACTCT---- .........(((((((((.(((((((.....))))))).)))).)))))....(((((.....(((((((....))))))).))))).((..(....(((..(((((((.((..((.((((((.(((.(((((...)))))))).))..))))))..)).....)))))))))).....)..))...(((((((.......))))..)))---- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________(__________________)______________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 88.571 IV: 77.778 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 2325
End: 2534 |