| GI |
269930234  |
| Accession |
GU143031 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGTACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGCTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-1.9 kcal/mol |
| Model |
223551594 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAA-TTCTCAACCC---ATAGATCCTTGTGGTCTA----CGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCCGGCCCTTACATGGGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGA-ATCGGCT---CTCAGTGTGATAATTGTCTA--CGCTGTGGCCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCGTTAGGACAACTTCTTGACATCTGA-----------------------------------------
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Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGTACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGATCGCTGAGGACAT----CTTTTGG---GATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGCTTCCACTTTTCAGCTTTGA
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CBCs: ______________(_(__________________________)_)_____________(_______((___________))_____)__________________________________(_______________________________________)________________________________(___________)__________________________________________________
HCBCs: _____________________((__(_______)__))___________________(___________(_________)_________)_____________________((____________(_________(_(__(____)___)___)_____)_____________))___________________(___(_____)___)_________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 84.615
II: 75
III: 76.923
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 425
End: 675
|
