| GI |
281199952  |
| Accession |
GU213475 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma japonicum
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| Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTATAGGTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTATGACCTCTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-44.9 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAA--CTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
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Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT--CTTTATAGGTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGC--GTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTATGACCTCTGA
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CBCs: __________________________(____)_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________(______(______________)______)___________________________________________________________(__________________________________________________________________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 89.474
II: 92.308
III: 92.593
IV: 100
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| Model for |
root
| cellular organisms
Eukaryota
Fungi/Metazoa group
Fungi
Dikarya
Basidiomycota
Agaricomycotina
Agaricomycetes
Agaricomycetes incertae sedis
Polyporales
Ganodermataceae
Ganoderma
Ganoderma lucidum
| Ganoderma sinense
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| Polyporaceae
Polyporus
Polyporus alveolaris
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 411
End: 621
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