| GI |
309261062  |
| Accession |
HQ235634 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma sinense
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTATAGGTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTATGACCTCTGA |
| Structure |
....((..(((((((((.((((..(((....))))))).)))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))....)))))))).......((((((....)))))).................. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-44.9 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAA--CTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((--((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))..................
Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT--CTTTATAGGTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGC--GTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((.(((...(((....))).))).)))).))))).))(((((...(((((.--((....)).))))).)))))..........((((((..((...((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))--.....)))))))).......(((((......)))))..................
CBCs: __________________________(____)_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________(______(______________)______)___________________________________________________________(__________________________________________________________________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 89.474
II: 92.308
III: 92.593
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 408
End: 618
|
