GI |
55820079  |
Accession |
AY593865 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma japonicum
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTATAGGTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-44.9 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAA--CTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((--((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT--CTTTATAGGTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGC--GTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((.(((...(((....))).))).)))).))))).))(((((...(((((.--((....)).))))).)))))..........((((((..((...((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))--.....)))))))).......(((((......))))).................. CBCs: __________________________(____)_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(______(______________)______)___________________________________________________________(__________________________________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 89.474 II: 92.308 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 410
End: 620 |