GI |
281199954  |
Accession |
GU213477 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGTGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
....((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))................. |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-55.2 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTT---TGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGTGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTAT----AAGACAGC-TTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-.(((((((((...))).)))))).)))))....)))---...)))))))).......(((((..----)))))...-.............. CBCs: ___________________________________________________________________(____)______________________________________________________________________________________________________________(______)______________________ HCBCs: _____________(______(___(____)___)______)_____________________________________________________________________(_________(_________________________)________)_________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 395
End: 593 |