GI |
28625445  |
Accession |
AY188935 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; Glomerella ; Glomerella cingulata ; Colletotrichum gloeosporioides
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATNCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCNAATTTTCAAAGGTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-38 kcal/mol |
Model |
157697392 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCACTGCTTGGCGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTT-TGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.(((((...)-)).))))))..)))))))))))))..))).))))....)))...(((((((...))))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATNCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCNAATTTT-CAAAGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((.(...((((.((((.(((.(...)..).))))))..))))).)))))))..))).))))....)))....((((((-..)))))).. CBCs: _______________________________________(_____)________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 93.75 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 331
End: 495 |