GI |
29150734  |
Accession |
AY218421 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Polyporus ; Polyporus squamosus
|
Sequence |
ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTTGTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTGATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTCCTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCGATTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCGATATTGAGAGACAGCTTTTGAACATGACATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-19.8 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATC-TACAAACTTCTTATGGGGTTTG--TAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGAT-AATGTCTACGCCGCGACCG-TGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTAC--AGAGACAACTTTT----ATGACCTCTGA ....((..(((((((-((((((((((....))))))))--)))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((-...))).))))))))))))-....))).....))))))))).......(((((.....--.))))).......----........... Query: ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTT----GTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTGATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTC-CTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCG-ATTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCGATATTGAGAGACAGCTTTTGAACATGACATCTGA ....((...((((((..((((((.(..----).)))))..).)).))))..))(((((...(((((..((......))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(.-.(((((((((....))).))))))..)))).....)))-....))))))))).......(((((........)))))...................... CBCs: ____________________________________________________________________((______))__________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(_____________________________)__________________((((____________))))_____________________(______________((__(___(_____(________)______)__)_))_________________)___________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 78.947 II: 92.308 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 372
End: 589 |