GI |
291586609  |
Accession |
GU726923 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGATTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-52.4 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTC-TCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGA-------TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGT-TGGAGACAACTTTA----------- ....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((.........(((.((-.(((((((((...))).)))))).)))))...-------...)))))))).......(((((...-..))))).......----------- CBCs: ___________________________________________________________________(____)___________________________________________________(__________________)_____________________________________________________________________ HCBCs: _____________(__(___(___(____)___)___)__)_______________________________________________________________________________(_________________________)__________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 81.481 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 412
End: 599 |