| GI |
2921  |
| Accession |
X63130 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Agaricales ; Marasmiaceae ; Lentinula ; Lentinula edodes
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| Sequence |
ATTAAATTCTCAACTTTATAAGTTTTTACTTATTAAAGCTTGGATGTTGGAGGCTTGCAGGCGTTTGTCAGCTCCTCTTAAATTTATTAGTGGGAACCCTGTTTTGTTAGTTCTAACCTTGGTGTGATAATTATCTACATTTTGGTGGAACCTTACAAATAATAAAGCTCTATTGGTTTGGGTTGTTGCATTTAGTTTGCTCAATCTGTTCTATTCATTGGAGAAAAAGGGAAGTTCTGCTTTCTAACTGTCTTGATTGACTATATATAACTTATTTGCTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-3.5 kcal/mol |
| Model |
298354133 |
| Alignment |
Sbjct: ATAAAATTCTCAACCTCTCTTAGTTTATGGCTAAGTTAGGCTTGGATCATGGAAGC-TGCTGGCTAGTCAAGTTAGCTCTTCTAAAATACATTTGCAAAGAT----ATTTGCTGA--CTATGTTTGATATGATAATTATCTATATCATTCATGATCAGTGTCCCTTTGCCTCTAATAG---TCTGCTAGACAAACTTGACAACTTTT-----------------------------------------------------------------------------------------
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Query: ATTAAATTCTCAA-CTTTATAAGTTTTT-ACTTATTAAAGCTTGGATGTTGGAGGCTTGCAGGCGTTT---GTCAGCTCCTCTTAAATTTATTAGTGGGAACCCTGTTTTGTTAGTTCTAACCTTGGTGTGATAATTATCTACATT--------TTGGTGGAACCTTACAAATAATAAAGCTCTATTGGTTTGGGTTGTTGCATTTAGTTTGCTCAATCTGTTCTATTCATTGGAGAAAAAGGGAAGTTCTGCTTTCTAACTGTCTTGATTGACTATATATAACTTATTTGCTTGA
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CBCs: __________________(_(___________)_)__________________(_________________________)_______________(__(______________(______________(_____________)____________)________)__)_________(____________)_________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _______________________(_____)_______________________________(___________)______________________((_____________((_(__________((_________________))________)_))_______))________________(___)____________________________________________________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 84.615
II: 76.923
III: 76
IV: 75
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 444
End: 726
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