GI |
296427697  |
Accession |
HM053460 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGTCCTTCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGAAACCCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-55.4 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGA---CCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).)))))))))---)))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGTCCTTCGGCTC-TCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGAAACCCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGT-TGGAGACAACTTTA----------- ....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-.(((((((((...))).)))))).))...)))....)))---...)))))))).......(((((...-..))))).......----------- CBCs: ___________________________________________________________________(____)___________________________________________________(__________________)________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(__(___(___(____)___)___)__)_____________________________________________________________________(_________(_________________________)___________)_________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 400
End: 594 |