| GI |
296427699  |
| Accession |
HM053462 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTAT |
| Structure |
....((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......(((((.....)))))........ |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-58.1 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))..................
Query: ATGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTC-TCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGT-TGGAGACAACTTTAT----------
....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-.(((((((((...))).)))))).)))))....)))---...)))))))).......(((((...-..)))))........----------
CBCs: ___________________________________________________________________(____)___________________________________________________(__________________)_____________________________________________________________________
HCBCs: _____________(__(___(___(____)___)___)__)_______________________________________________________________________________(_________________________)__________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 94.737
II: 100
III: 92.593
IV: 100
|
| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 401
End: 593
|
