GI |
298354052  |
Accession |
AB509663 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma applanatum
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACTTRCRAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTKAATGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTYTGGCAAGCTTCTAAYCGTCTCGTTACGGAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-40.2 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGG-TTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((.-.(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACTTRCRAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCTTKAATGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTYT---GGCAAGCTTCTAAYCGTCTCGTTACGGAGACAGC-TTTATGACCTCTGA ....((..((((((((.(.((((((....)))))).).))).))))).))(((((...(((((--((......))))))).)))))..........((((((...((..(((....(((.-((.(((.(((((...))).)).))))).)))....)))...---)))))))).......(((((......)))))...-.............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________((_____(__((____))__)_____))___________________________________________________________(___________________________________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 89.474 II: 92.308 III: 88.889 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 105
End: 311 |