GI |
298360976  |
Accession |
HM044468 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillus
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATAGGGTGCTTGGATACTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGACGAAAGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTNTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTNGCNNAAGTGCATGAATGAATGGTNCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGNCNTTTTGGNGTCTTCCTTATTGACTTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-58.5 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATG-CCTTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((-((....)))))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATAGGGTGCTTGGATACTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGACGA-AAGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTNTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTNGCNNAAGTGCATGAATGAATGGTNCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGNCNTTTTGGNGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((..-..))))))).))).))).)))))..........(((..((((...(((((((..(.(((((......((....((((((((....)))).)))).))....))))).)..)))).))).)))))))..(((((....(((..(......).))).....)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________________________________________(_________________)__________________________________________________________________________________________________________________________________(___________)____________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 88.235 IV: 81.818 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 346
End: 591 |