GI |
298360992  |
Accession |
HM044484 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillus
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATNGGGTGCTTGGATACTGGGGGCTGCCGGAGACCTGNACTCTCNNCTAGGACTCGGGCTCTCCNGAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATNANGATCGCCGTTCGCTGAAGTGNNTGAATGAATGGTCCCNTGCCTCTNATGCGTCGACGCCTTNTTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-34.5 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTC-TGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((...-.)))))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATNGGGTGCTTGGATACTGGGGGCTGCCGGAGACCTGNAC-TCTCNNCTAGGACTCGGGCTCTCCNGAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATNANGATCGCCGTTCGCTGAAGTGNNTGAATGAATGGTCCCNTGCCTCTNATGCGTCGACGCCTTNTTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.(((..((((......))))..)))...))))......((((..(((.(((.((((...-.......)))).))).))).))))...........(((..(.((..((((((((..(...(((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))...)..)))).)))))).))))..(.(((....((((((.....)))))).....))).)........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________________________________________(_________________)_________________________________________________________________(_________________)______________________________________________(___________)____________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 91.667 II: 77.778 III: 85.294 IV: 90.909 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 341
End: 586 |