GI |
299766330  |
Accession |
HM234148 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillus
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGTTTCGAGCGGGTGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTTATTTCAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTTGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTTAGCTGAAGTGCATGAATGAACCGTCCTGCGCCTCTAATACGTCGACGCTTTCCAGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-63.1 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....)))))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGTTTCGAGCGGGTGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTTAT--TTCAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTTGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTTAGCTGAAGTGCATGAATGAACCGTCCTGCGCCTCTAATACGTCGACGCTTTCCAGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA .........((((.(((..((((......))))..)))...)))).....(((((..(((.(((.((((((.....--)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((.((((..(.(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...))))).)..))))..))))))))))..(((((....((((((....)))))).....)))))........ CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(____)_______________________ HCBCs: _________________________________________________________________(__((_________))__)_____________________________(_(_________________________________(_________________)___________________________)_)_________(______(__________)_______)____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 91.667 II: 94.444 III: 91.176 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 228
End: 471 |