GI |
299778149  |
Accession |
HM069381 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGATTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGGCTCGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGGTCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTAGGGGCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-70.3 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGAT-CTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAAT-GGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCT--GGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(-((((((.....))))))).))).))).))))).........-((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....--)))))).....)))))........ Query: ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGA---TTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGGCTCGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGGTCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTAGGGGCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA .........((((.(((..((((......))))..)))...)))).....(((((..(((.(((.(.(((((---....)))))).))).))).)))))..........((((..((((..(((((((...(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))...))).)))))))))))).(((((....((((((......)))))).....)))))........ CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________________________)__________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________((___________(___(___________)__)__________))______________________________________________(_______(_____(____)______)____)__________________________________(______(____________)_______)____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 91.667 II: 94.444 III: 97.059 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

environmental samples

uncultured fungus

| uncultured ectomycorrhizal fungus

|
| Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetidae

Boletales

Suillineae

Suillaceae

Suillus

Suillus luteus

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| environmental samples

uncultured Suillaceae

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 428
End: 674 |