| GI |
121487805  |
| Accession |
AJ810034 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Rhizopogonaceae ; Rhizopogon ; Rhizopogon rubescens
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| Sequence |
AGTTAATTCATCAACCCCTTTCGATTAGCTTTGAGGGGGAGCTTGGATAGTGGGGGTTGCCGGAGACTTGGGACTAGTTCCAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCGCGAAAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTGTGCTGAAGTGCATGAATGATGGTCCTGTGCCTCTAATACCCATCATCGACCTTTTACTAGGTCTTTGAAATTTGACATTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-52 kcal/mol |
| Model |
176063 |
| Alignment |
Sbjct: AGTAAATTC-TCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATG-----TGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTCCTTA-TTGAC-TTTTGA
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HCBCs: __________________(___(________)___)______________________________((_(_(_______)_)_))_______________________________(__________________((_____________(_________________)________))_________________)_______________________(__________)______________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 94.444
III: 88.235
IV: 81.818
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| Model for |
root
| cellular organisms
Eukaryota
Fungi/Metazoa group
Fungi
Dikarya
Basidiomycota
Agaricomycotina
Agaricomycetes
Agaricomycetidae
Boletales
Suillineae
Rhizopogonaceae
environmental samples
uncultured ectomycorrhiza (Rhizopogonaceae)
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 460
End: 711
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