GI |
1225971  |
Accession |
X74921 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Bondarzewiaceae ; Heterobasidion ; Heterobasidion annosum species complex ; Heterobasidion annosum
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Sequence |
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCTGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTCATCGAAACTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-50.5 kcal/mol |
Model |
76786575 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAACCC--CGTCTTCTTTYTTGAAGAGCGGAGG-TTGGACTTGGAGGTCGTTGCCGGTCCTTTTGTGATCGGCTCCTCTGGAATGCATTAGCGAGACCCTTGCGGTGGCG-CCTTGGTGTGATAATTGTCTACGCCATGGACGTGCCGCGATTTCATGGGGCGCTCGCTTCGAACCGTCGCAAGAC-ACTTTCATCGAACC---- .........(((((((--(((((((......))))).))).))-))))..(((((((.....(((((((.......))))))).)))))))........((((((.(((((((((((.((-((.(((((((((....))).)))))).)).))))))))))......)))...))))))((((...(((....)))-.......))))...---- Query: GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGG-CTTTGCTGGTCCTCGCG-GATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCTGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATT--GTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTCATCGAAACTTGA .........((((((...((.((((......))))..))..)).))))..(.(((((-....(((((((......-))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((.((.((.(((((((((....))).)))))).)).))))))))))..--..)))...).))))((.(...(((....)))........).))....... CBCs: ________________________(______)______________________________________________________________________________________(_____(_____________________)_____)______________________________________________________________ HCBCs: _____________________(____________)_______________(_____________(_______________)_________)___________(_________(__((__(_______________________________)_))__)_________________)_______________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 92.857 III: 96.667 IV: 85.714 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetes incertae sedis

Russulales

Bondarzewiaceae

Heterobasidion

Heterobasidion araucariae

| Heterobasidion annosum species complex

Heterobasidion annosum

| Heterobasidion parviporum

| Heterobasidion abietinum

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 367
End: 577 |