| GI |
1225973  |
| Accession |
X74923 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Bondarzewiaceae ; Heterobasidion ; Heterobasidion annosum species complex ; Heterobasidion annosum
|
| Sequence |
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTCATCGAAACTTGA |
| Structure |
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))....)...).))....... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-48.6 kcal/mol |
| Model |
76786575 |
| Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAACCC--CGTCTTCTTTYTTGAAGAGCGGAGG-TTGGACTTGGAGGTCGTTGCCGGTCCTTTTGTGATCGGCTCCTCTGGAATGCATTAGCGAGACCCTTGCGGTGGCG-CCTTGGTGTGATAATTGTCTACGCCATGGACGTGCCGCGATTTCATGGGGCGCTCGCTTCGAACCGTCGCAAGAC-ACTTTCATCGAACC----
.........(((((((--(((((((......))))).))).))-))))..(((((((.....(((((((.......))))))).)))))))........((((((.(((((((((((.((-((.(((((((((....))).)))))).)).))))))))))......)))...))))))((((...(((....)))-.......))))...----
Query: GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGG-CTTTGCTGGTCCTCGCG-GATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATT--GTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((...((.((((......))))..))..)).))))..(.(((((-....(((((((......-))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..(.((.(((((((((....))).)))))).)).).))))))))..--..)))...).))))((.(...(((....)))........).)).......
CBCs: ________________________(______)____________________________________________________________________________________________(_____________________)____________________________________________________________________
HCBCs: _____________________(____________)_______________(_____________(_______________)_________)___________(_________(__((__(_______________________________)_))__)_________________)_______________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 85.714
II: 92.857
III: 93.333
IV: 85.714
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 367
End: 577
|
