| GI |
304272893  |
| Accession |
GU180272 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTATGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAATGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTGTTGCAAGTTATTTCAATCTGTAATGCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-4.3 kcal/mol |
| Model |
164514098 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATCT-TCAACCTACAA--GCCTTTGCG---GTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCG-GCCCTYTGTC-GGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGG-ATCGGCT---CTCGGTGTGATAAT-GTCTA--CGCCGCGACCGTGAAGC-GTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTT-CGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA-----------------------------
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Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTATGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAATGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTGTTGCAAGTTATTTCAATCTGTAATGCCACTTTTCAGCTTTGA
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CBCs: ______________(___((__________________))___)___________(_(___________________________)_)________________(_______________(__________(_____________________)______)______________)____________((___________))_______________________________________________
HCBCs: ______________________________________________________________(____(__________)___)__________________(_______((_____________(________(_(___________)___)_____)______________))____)________(_______________)______________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 80
II: 75
III: 84
IV: 83.333
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 374
End: 623
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