GI |
306846738  |
Accession |
HQ021909 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
ATTAAATTCTCAACTTCAAATTGAATTTTGAAGCTTGGACTTTGGAGGTTTGCTGGTGTCACTATCAGCTCCTCTTAAATTCATTAGCGGAACTGTAAGGACCGGCTTTGGTTTGATAGCTAACATTATCTATGCCGTTGCTGTGACCTTTGTGTTTGGCTTCTAATGGTCATTTTGTTGACTGTCTCTGCTTTGAGGCATACACTTTTAAGCTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-3.7 kcal/mol |
Model |
228015437 |
Alignment |
Sbjct: ATGGAATTCTCAACCCATAGATTCTTGTGGTCTATGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCCGGCTCTAGTCAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATA------ATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGTGTTTGGCAAGCTTCCAACTGTCCCTGTG-GGACAACCTTTGACATCTGA------------------- .........((((((((((((((.....)))))))))).))))....(((((....(((((((......))))))).)))))..........((((((...(((.(((...(((.((.(((((((((.------...))).)))))).))))).....))).)))))))))......((((((...)-)))))...............------------------- Query: ATTAAATTCTCAACTT-CAAATT----GAATTTTGAAGCTTGGACTTTGGAGGTTTGCTGGTGTCA--CTATCAGCTCCTCTTAAATTCATTAGC--GGAACTGTAAGGACCGGCT-TTGGTTTGATAGCTAACATTATCTATGCCGTTGCTGTGACCTTTGTGTTTGGCTTCTAATGGTCATTTTGTTGACTGTCTCTGCTTTGAGGCATACACTTTTAAGCTTGA .........(((((((-.(((((----.)))))..))).)))).....((.(....(((((((...--.))))))).).))...........(((--(....((.(((...(((.(-.((((.((((..........))).).))))..)))).....))).)).)..)))......((((((...).))))).................................. CBCs: ______________((___(___________)___))_____________________(__((______))__)________________________________(____________(_________________________)_____________)_________________(___(______)___)__________________________________ HCBCs: _____________________((_____))___________________(_____________________________)_________________(____(__(______(__(__(_______(__________)________)__)_)________)__)_)________________(___)________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 83.333 III: 80.769 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 228
End: 444 |