GI |
205364292  |
Accession |
FJ157117 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Agaricales ; Cortinariaceae ; Cortinarius ; Cortinarius cf. balteatus SMI15
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Sequence |
ATTAATATATCAACCTCTTCAGCTTTTGCTTGTTGAGTGTTGGATGTGGGGGTCTTTTTGCTGGTCTTCCCAGGTCAGCTCCCCTGAAATGCATTAGCGGAACAATTTGTGGACCGTTCATTGGTGTGATAACTATCTACGCTATTGACGTGAAGCAGTTCAGCTTCTAACAGTCCATTCACTTGGACAAATTTTCATTAATGTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-42.8 kcal/mol |
Model |
84993956 |
Alignment |
Sbjct: ATTAATATATCAACCTCTTCGACTTCTGTCTGTTGAGCGTTGGATGTGGGGGTATTTTTTGCTGGTCTCTCTGAGGTCAGCTCCCCTAAAATGTATTAGCGGAACAATTTGTGGACCGTTCATTGGTGTGATAACTATCTACGCTATTGACGCAAAGCAGTTCGGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATTTTCATTAATGT-- .........((((((((..((((....))).)..))).)))))...((((((........(((((((((...))))))))).))))))...(((...(((.((((..((((((......(((.(((((((((....))).)))))).)))))))))...)))).)))....)))(((((......)))))................-- Query: ATTAATATATCAACCTCTTCAGCTTTTGCTTGTTGAGTGTTGGATGTGGGGGT-CTTTTTGCTGGTCT-TCCCAGGTCAGCTCCCCTGAAATGCATTAGCGGAACAATTTGTGGACCGTTCATTGGTGTGATAACTATCTACGCTATTGACGTGAAGCAGTTCAGCTTCTAACAGTCCATTCACTTGGACAAATTTTCATTAATGTGA .........((((((((..((((....))).)..))).)))))...((((((.-......((((((((-....)))))))).))))))...((....(((.((((..((((((......(((.(((((((((....))).)))))).)))))))))...)))).))).....))(((((......))))).................. CBCs: ____________________((______))__________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________(________________________________________)_____________________((_________________________________________))______________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 93.333 III: 96.429 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetes incertae sedis

Corticiales

Punctulariaceae

Punctulariopsis

Punctulariopsis subglobispora

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 412
End: 617 |