GI |
31074219  |
Accession |
AY254863 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
GAAACTCTCAAACAAAGTAGATTCGTTTCTACCTCTGTTTGGATTTGGACTCTGCTGCGTCAATGCGGCTGGTCTTAAATATATTAGCTGATCCTAGCGAAGGTTTGGTTCTACTCAGCATGATAATTATCTGATGTTGAGGACAGTCTTAGGACTGGCCAGGCTCTCTATGGATTGCTTCCAATCGTCTTTGGACAATCATTCAATATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-25.3 kcal/mol |
Model |
119507097 |
Alignment |
Sbjct: ATTGAAACTCTCAAATAAAGGTAGCTTTGTAGCTGTCTCTGTTTGGATTTGGACTTTGCTGCATTAATGTGGCTAGTCTTAAATGCATTAGCTGGTCCTCATTGAGGTTTGGTTCCACTCGGCGTGATAATTATCTAACGTTGAGGACAGTCTCAGGACTGGCCATGGCTCTCTCTCTGGATTGCTTCTAAATTGTCTTCAGGGCAATCACTTAATTTCTGA ..........(((((((.((((((((....)))))))).)))))))....(((((..((((((....)))))).))))).....((....((((((((....((((..(((......((((((((............))))))))..))).))))))))))))....))..........(((((((.((.((.....)).)))))))))............. Query: ---GAAACTCTCAAACAAA-GTAGATTCGTTTCTACCTCTGTTTGGATTTGGACTCTGCTGCGTCAATGCGGCTGGTCTTAAATATATTAGCTGATCCTAGCGAAGGTTTGGTTCTACTCAGCATGATAATTATCTGATGTTGAGGACAGTCTTAGGACTGGCCAGG---CTCTCTATGGATTGCTTCC-AATCGTCTTT-GGACAATCATTCAATATCTGA ---.......(((((((.(-(((((......))))).).)))))))....(((((..((((((....)))))).)))))...........((((.(((.....(((..(((......((((((((............))))))))..))).))).))).))))....---.........(((((.(.(.-((.....)).-)).)))))............. CBCs: ________________________(______)_______________________________________________________________________(___________________(______________)______________)____________________________________________________________________ HCBCs: _______________(____((____________))____)_____________(_____(_(____)_)____)_____________________________________________(____________________)________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 86.667 II: 100 III: 84 IV: 81.818 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 375
End: 161 |