Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

GI 3114852

Figure

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Details

GI 3114852 see NCBI Nucleotide
Accession Z95575
Date 2011/04/01
Lineage see NCBI Taxonomy root cellular organisms Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Streptophytina Embryophyta Tracheophyta Euphyllophyta Spermatophyta Magnoliophyta eudicotyledons core eudicotyledons rosids fabids Fabales Fabaceae Papilionoideae Crotalarieae Lotononis Lotononis galpinii 
Sequence CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGTGCTAGGCACCGAATGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCATTGCGACTCTATGGCCCATGGGGTCTTTTGGTCGCCAATGACGGGA
Structure (((..((((((((((((((.(((.....)))))))))....)))))))))))..((((..(((.((((...).))).)))..)))).......(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....)))))).)))))))))).))))..)).))))).))...).))))).....(((((((((((....)))).)).))...))).
Method 2: Homology modeled
Energy -71.2 kcal/mol
Model 324106468
Alignment
Sbjct: GCACATCGTTGCCCT-GTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGTAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCATGTGTGTCACCTCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGACCGCCCAAGACGGGA
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Query: ---CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGTGCTAGGCACCGAATGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCATTGCGACTCTATGGCCCAT-GGGGTCTTTTGGTCGCCAATGACGGGA
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 CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ______________(______________________________)_________________________________________________________(__________(___(____________________________________)____)_____________)_________________________((______))______________
Transferred percentage of helices I: 95
II: 100
III: 97.059
IV: 90.909
Annotation Process: Genbank annotation
Start: 1
End: 220

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