GI |
1754539  |
Accession |
AB000001 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris ; Rhizoctonia solani
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Sequence |
ATGAAATCTTCAAAATCAAGTCTTTTGTTAATTCAATTGGCTTTGACTTTGGTATTGGAGGTCTTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTACATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACTGTAAAAAGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACAATATTTTTATGATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-23.3 kcal/mol |
Model |
117938168 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCTTCAAAGT-AAATCTTTTGTTAACTCAATTGGTNCT-ACTTTGGTATTGGAGGTCTTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTCGTTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACTGTAACAC-GTGGCCAAGGGAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACACTATTTTTATGATCTGA .........(((((((-(.(((..(((......)))..)))..)-)))))))....(((((.....((((........)))).)))))..(((((((.((....((((.((((((((....(((...(((((((.((((...))))...))))))))))..))))))))-........))))...)).)))))))...........(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAAAATCAAGTCTTTTGTTAATTCAATTGGCTTTGACTTTGGTATTGGAGGTCTTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTACATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACTGTAAAAAGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACAATATTTTTATGATCTGA .........(((((.(.(.(((..(((......)))..)))..).).)))))....(((((.....((((........)))).)))))..((.((((.((....(.((..(.(((((....(((...(((((((.((((...))))...))))))))))..))))).)..........)).)...)).)))).))...........(((((......))))).................. CBCs: ___________________(____________________)_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 100 III: 88.571 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 382
End: 621 |