GI |
1101882  |
Accession |
U19964 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAATTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGATTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACAATATCTAATTTATGATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-13.7 kcal/mol |
Model |
117938168 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCTTCAAAGT-AAATCTTTTGTTAACTCAATTGGTNCTACTTTGGTATTGGAGG-TCTTTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTCGTTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACA--CTGTAACAC----GTGGCCAAGGGAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACACTATT---TTTATGATCTGA .........(((((((-(.(((..(((......)))..)))..))))))))....(((((-.....((((........)))).)))))..(((((((.((....((((.((((((((....(((...(((((((.((((...))))...)))))))))).--.))))))))----........))))...)).)))))))...........(((((......)))))......---............ Query: ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAATTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGATTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGACAATATCTAATTTATGATCTGA .........(((((((.(.(((..(((......)))..)))..))))))))....(((((......((((........)))).)))))..((.((((.((....(.((..(.(.(((....(((...(((((((.((((...))))...))))))))))....))).).).............)).)...)).)))).))...........(((((......)))))..................... CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________(____(__________________)____)___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 85.714 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 370
End: 617 |