GI |
317415371  |
Accession |
FM200621 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; unclassified Fungi ; fungal endophyte sp. AP411
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGGTT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-33.9 kcal/mol |
Model |
148807690 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTCA-AGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.....-.))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATTCGGA-GGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGGTT-- ....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((.(((.(((...((((.((((.((..((-....))))))))..))))))))))-))....))))))....)))....((((.......))))-- CBCs: ____________________________________(___________)_____________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________(________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 96.667 IV: 80 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 341
End: 502 |