| GI |
222350171  |
| Accession |
FM992896 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
..........(((((((.((..((((.....)...))))).))).)))).....((.(...(((((.(((......)))))))).).))............((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..).)..))).))))........(....(.(....).))............................................. |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-9.7 kcal/mol |
| Model |
157704064 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATCT-TCAACCTACAA--GCTTTTGTG---GTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCG-GCCGTT--ATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGG-ATCGGCT---CTCGGTGTGATAA-TGTCTA--CGCCGYGACCGTGAAGC-GTTTGGCGAGCTTCTAACCG----TCTTATAAGACAG--CTTTATGACCTCTGA--------------------------
........(-(((((((((((--(((.....)---))))))))).)))))...(((((...((((-((((..--..)))))))).)))))..........((((((...((.(((..-..(((.(---(.(((((((((..-.))).)--))))).)))))....))-)...)))))))).......(----(((....))))..--...............--------------------------
Query: GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.((...(((.....)...)).)).))).)))).....((.(...((((..(((......))).)))).).))............((((....((.((......((..(...(.(((((((((....))).)..))))).)).)).....).)...)).))))........(....(.(....).)).............................................
CBCs: ______________(___((__________________))___)___________(_(___________(______)________)_)________________(_______________(__________(_____________________)______)______________)________________(________)______________________________________________
HCBCs: ______________________________________________________________(___________________)__________________(_______(___(__________(________(_(___________)___)_____)________)______)____)_____________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 80
II: 76.923
III: 84
IV: 75
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 372
End: 619
|
