GI |
33325346  |
Accession |
AF516591 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Polyporus ; Polyporus squamosus
|
Sequence |
ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTTGTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTGATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTCCTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCGATTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCGATATTGAGAGACAGCTTTTTGAACATGACATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-19.8 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATC-TACAAACTTCTTATGGGGTTTG--TAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGAT-AATGTCTACGCCGCGACCG-TGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTAC--AGAGACAACTTTT-----ATGACCTCTGA ....((..(((((((-((((((((((....))))))))--)))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((-...))).))))))))))))-....))).....))))))))).......(((((.....--.))))).......-----........... Query: ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTT----GTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTGATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTC-CTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCG-ATTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCGATATTGAGAGACAGCTTTTTGAACATGACATCTGA ....((...((((((..((((((.(..----).)))))..).)).))))..))(((((...(((((..((......))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(.-.(((((((((....))).))))))..)))).....)))-....))))))))).......(((((........)))))....................... CBCs: ____________________________________________________________________((______))___________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(_____________________________)__________________((((____________))))_____________________(______________((__(___(_____(________)______)__)_))_________________)____________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 78.947 II: 92.308 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 364
End: 582 |