| GI |
253326976  |
| Accession |
GQ240920 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
| Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGGTGGCTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTTTGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCCTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-15.1 kcal/mol |
| Model |
296427702 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATCT-TCAACCT--GCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCG-----GCCGTTCTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGG-ATCGGCT---CTCAGTGTGATAAT-GTCTA--CGCTGCGACCGTGAAGC-GTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCTAGTTGGAGACAACTTTA--------------------------------------
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Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGGTGGCTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTTTGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCCTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
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CBCs: ______________(_____(_(___________)_)___)___________(_(____________(__(____)__)_____)_)________________(_______________(_______________________________________)______________)____________(__((____))__)______________________________________________
HCBCs: ___________________________________________________________(________(________)___)__________________(_______(___(__________(________(_(___________)___)_____)________)______)____)_____________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 80
II: 84.615
III: 88
IV: 83.333
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 371
End: 617
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