GI |
323361118  |
Accession |
HQ184178 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Coriolaceae ; Trametes ; Trametes sp. UFMGCB 1984
|
Sequence |
ATGAAATTCTCAAACCCATAAGTCTTTGCGGGCTTATGGGCTTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCGTACTGCAAAGTCATCGACTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGACTATCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTTGGTCGTGAAGCGTTTATGGCGAGCTTCTAATCGTCTCTTAACGAGACAGCTTACATTGGCCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-53.2 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT-CCCTTTACAG--GTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAA-TGTCTACGCCG-CGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTA-TGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((.-.(((....))--)))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((..-.))).))))))-))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))........-.......... Query: ATGAAATTCTCAAACCCATAAGTCTTTGCGGGCTTATGGGCTTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCGTACTGCAAAGTCATCGACTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGAC-TATCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTTGGTCGTGAAGCGT-TTATGGCGAGCTTCTAATCGTCTC-TTAACGAGACAGCTTACATTGGCCTCTGA ....((...((((.(((((((((((....)))))))))))..))))..))(((((...(((((....((....))...))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.-((.(((((((((....))).)))))).)).)))....))).-....)))))))).......(((((-.....)))))................... CBCs: _______________((((__(__________)__))))_________________________________________________________________________________(___(_________________________)__)_________________________________________________________________ HCBCs: _______________________((____))____________________________(_____________________)_________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 89.474 II: 92.308 III: 92.593 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 348
End: 563 |