GI |
323651449  |
Accession |
HQ222603 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
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Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCATGAAGCGTTTGGCGAGCTTTCTAACCATCTTATAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-49.2 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGC-TTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))-).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCATGAAGCG---TTTGGCGAGCTTTCTAACCATCTTAT----AAGACAGC-TTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((.....((.((-.(((((((((...))).)))))).)))).....)))---...))))))).)........((((..----))))....-.............. CBCs: ___________________________________________________________________(____)_______________________________________________________________________________________________________________(______)______________________ HCBCs: _____________(______(___(____)___)______)_______________________________________________________________________________(_________________________)___________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 88.889 IV: 80 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 416
End: 615 |