| GI |
323651450  |
| Accession |
HQ222604 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTATAATGTCTACGCCGTGACCATGAAGCGTTTGGCGAGCTTTCTAACCATCTTATAAGACAGCTTTAT |
| Structure |
....((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).))))).........((((((..((..(((...((((.((.((((((((...))..)))))).))))..)).)))...))))))).)........(((....)))......... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-44.7 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGC-TTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))-).......(((((......)))))..................
Query: ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAAT-CATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGT-ATAATGTCTACGCCGTGACCATGAAGCG---TTTGGCGAGCTTTCTAACCATCTTAT----AAGACAGCTTTAT----------
....((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).))))).....-....((((((..((..(((.....((.((-.((((((-((...))..)))))).)))).....)))---...))))))).)........((((..----)))).........----------
CBCs: ___________________________________________________________________(____)_______________________________________________________________________________________________________________(______)______________________
HCBCs: _____________(______(___(____)___)______)_______________________________________________________________________________(_________________________)___________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 94.737
II: 100
III: 85.185
IV: 80
|
| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 378
End: 566
|
