GI |
34979721  |
Accession |
AY320289 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Poritidae ; Porites ; Porites lobata
|
Sequence |
GGATTTTATCGAACGCGCATGACTTGACTGACTCGTGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAAAGTTGAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGGCAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATACTATTTTCCTTCGCCCAAAAAACCAATAGCAGACGGTCCCAATAGCTGAGACAAAGAAAGCGGTGACAATAAATATCCAAAAAAATCTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-45.7 kcal/mol |
Model |
225638481 |
Alignment |
Sbjct: -------------CGCGCATGACTTGACTGAGTCGTGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAAAGTTGAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGGCAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATGGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATACTATTTTCCTTCGCCCAAAAAACCAATAGCAGACGGTCCCAATAGCTGAGACAAACAAAGCGGTGACAATAAACATCCAAAAA-------- -------------((((((((((((....))))))))))))...((((((...(((((((..(((....)))..)))))))..)))))).......(((((((((((.((...(((((((((....(((...(((((((..(((.......))).))))))).)))....)).)))).))))))).))))).)))).............((((........))))......-------- Query: GGATTTTATCGAACGCGCATGACTTGACTGACTCGTGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAAAGTTGAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGGCAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATACTATTTTCCTTCGCCCAAAAAACCAATAGCAGACGGTCCCAATAGCTGAGACAAAGAAAGCGGTGACAATAAATATCCAAAAAAATCTTGA .............(((((((((.((....)).)))))))))...((((((...(((((((..(((....)))..)))))))..)))))).......(((((((((((.((...(((((((.(....(((...(((((((..(((.......))).))))))).)))....)..)))).))))))).))))).)))).............((((........)))).............. CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(________)_________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 91.667 II: 100 III: 97.143 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 366
End: 604 |