GI |
34979736  |
Accession |
AY320304 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Poritidae ; Porites ; Porites lobata
|
Sequence |
GGATTTTATCGAACGCACTCGTGAGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAGCAAGCAAGCATTAAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGGCAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATAATATTTTCCTTCGCCCAAAAATCCAATAGCAGAAAGAAAATCCAATCAAAGCGGTGACAGACAATAAACATCAAATCTTGA |
Structure |
.............((((((....))))))...((((((.(.(((((((.((((((......))..))).))))))))).))))))......((.(.((((((.(..(.((((((((((..(.(((.(.(((((((...(((((...))))))))))))))))...).)))))).)))).))...)))))))...))...((..((...(....)))...)).... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-35.8 kcal/mol |
Model |
283466362 |
Alignment |
Sbjct: --ATTTTATCGAACGCACTCGTGAGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAGCAAGCAAGCATTAAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGACAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAAATAATATTTTCCTTCGCCCAAACATGCAATAGCAGAAACAAAATCCAATCAAAGCGGTGAGTGACAATAAACATCAAATCTT-- --...........((((((....))))))...((((((...(((((((..(((((......))..)))..)))))))..))))))......((...((((((......((((((((((....(((...(((((((...(((((...)))))))))))).))).....)))))).))))......))))))....))...((.(((.........)))..))..-- Query: GGATTTTATCGAACGCACTCGTGAGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAGCAAGCAAGCATTAAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGGCAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATAATATTTTCCTTCGCCCAAAAATCCAATAGCAGAAAGAAAATCCAATCAAAGCGGTGACAGACAATAAACATCAAATCTTGA .............((((((....))))))...((((((...(((((((..(((((......))..)))..)))))))..))))))......((...((((((......((((((((((....(((...(((((((...(((((...)))))))))))).))).....)))))).))))......))))))....))...((..((.........))...)).... CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________(_______)____________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 80 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 374
End: 598 |