GI |
34979737  |
Accession |
AY320305 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Poritidae ; Porites ; Porites lobata
|
Sequence |
GGATTTTATCGAACGCACTCGTGACTCATGTGACTCGTGTGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTAAGCATTAGTAAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGACAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATAATATTTTCCTTCGCCCAAACATGCAATAGCAGAAACAAAATCCAATCAAAGCGGTGACAGACAATAAACATCAAATCTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-34.8 kcal/mol |
Model |
283466261 |
Alignment |
Sbjct: --ATTTTATCGAACGCACTCGTGGCTCATGTGACTCATGTGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAGCATTAGTAAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGGCTGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATAATATTTTCCTTCGCCCAAACATGCAATAGCAGAAAGAAAATCCAATCAAAGCGGTGACAGACAATAAACATCAAATCTTGA --...........(((((.(((((.((....)).))))).)))))...((((((...(((((((..(((.......)))..)))))))..))))))...(((((...((((((.((...((((((((((....(((...(((((((..(((.......))).))))))).))).....)))))).)))).))...))))))....)))))...............((((...)))) Query: GGATTTTATCGAACGCACTCGTGACTCATGTGACTCGTGTGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTAAGCATTAGTAAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGACAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATAATATTTTCCTTCGCCCAAACATGCAATAGCAGAAACAAAATCCAATCAAAGCGGTGACAGACAATAAACATCAAATCTTGA .............(((((.(((((.((....)).))))).)))))...((((((...(((((((..(.(.......).)..)))))))..))))))...((.((...((((((.(....((((((((((....(((...(((((((..(((.......))).))))))).))).....)))))).))))..)...))))))....)).))...............((((...)))) CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________(_(__________)_)______________________________________________________________(_____________________________________________________________________________________________________________)__________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 93.75 III: 94.444 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 375
End: 610 |