GI |
34979742  |
Accession |
AY320310 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Poritidae ; Porites ; Porites lobata
|
Sequence |
GGATTTTATCGAACGCACTCGTGAGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAGCAAGCAAGCATGAAATCGTCGTGTCCCTTGAAGGACAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATAATATTTTCCTTCGCCCAAACATGCAATAGCAGAAACAAAATCCAATCAAAGCGGTGACAGACAATGACAACATCAAATCTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-33.5 kcal/mol |
Model |
283466362 |
Alignment |
Sbjct: --ATTTTATCGAACGCACTCGTGAGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAGCAAGCAAGCATTAAATCGCCGTGTCCCTTGAAGGACAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAAATAATATTTTCCTTCGCCCAAACATGCAATAGCAGAAACAAAATCCAATCAAAGCGGTGAGTGACAATA--AACATCAAATCTT-- --...........((((((....))))))...((((((...(((((((..(((((......))..)))..)))))))..))))))......((...((((((......((((((((((....(((...(((((((...(((((...)))))))))))).))).....)))))).))))......))))))....))...((.(((.....--....)))..))..-- Query: GGATTTTATCGAACGCACTCGTGAGTGCGGTATTGAGGTGTCACGGCGTGTTAGCAAGCAAGCATGAAATCGTCGTGTCCCTTGAAGGACAGCAGCATTGGACTCGCATTCTCTATTGAAACTTGAGTGCGAAGGCTAAAGATAATATTTTCCTTCGCCCAAACATGCAATAGCAGAAACAAAATCCAATCAAAGCGGTGACAGACAATGACAACATCAAATCTTGA .............((((((....))))))...((((((...(((((((..((.((......))...))..)))))))..))))))......((...((((((......((((((((((....(((...(((((((...(((((...)))))))))))).))).....)))))).))))......))))))....))...((..((...........))...)).... CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________(__________________________)___________________________________________________________________(_______)______________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 94.444 III: 100 IV: 80 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 368
End: 594 |