| GI |
3688157  |
| Accession |
AJ006672 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Meruliaceae ; Bjerkandera ; Bjerkandera adusta
|
| Sequence |
ATGGAATTCTCAACCTTCGGCTTCATTGACGAAGCTTGGACTTGGAGGTCGTGCCGGCTCTCGTAGTCGGCTCCTCTGAAATGCATTAGTGCGAACGTTACCAACCGCTTCAGCGTGATAATTATCTGCGTTGCTGTGGAGGGTATTCTAGTGTTCACGCTTCTAACCGTCTTCGGACAAATTTCTGAACTCTGA |
| Structure |
.........(((((.((((.(......).))))).))))..(((((((..(.(((((((.....)))))))))))))))...(((((((.....(.(.((((..((((..(((((((((....))).))))))..))))..)))))))))))))......((..((..(..((((((.(...))))))))).))) |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-26.6 kcal/mol |
| Model |
27650401 |
| Alignment |
Sbjct: ATGGAATTCTCAACCTTCAGCTTTATTGTTGAAGGCTTGGACTTGGAGGTCGTGCCGGCTCTCGTAGTCGGCTCCTCTGAAATGCATTAGTGCGAACGTTACCAGCCGCTTCAGCGTGATAATTATCTGCGTTGCTGCGGAGGGTATTCTAGTGTTCACGCTTCTGACCGTCTTCGGACAAATTTCTGAACTCTGAGCT
.........((((((((((((......)))))))).))))..(((((((....(((((((.....))))))).)))))))...(((((((.........((((..((((..(((((((((....))).))))))..))))..))))..)))))))....((((..((.....((((((......)))))).)).)))).
Query: ATGGAATTCTCAACCTTCGGCTTCATTGACGAA-GCTTGGACTTGGAGGTCGTGCCGGCTCTCGTAGTCGGCTCCTCTGAAATGCATTAGTGCGAACGTTACCAACCGCTTCAGCGTGATAATTATCTGCGTTGCTGTGGAGGGTATTCTAGTGTTCACGCTTCTAACCGTCTTCGGACAAATTTCTGAACTCTGA---
.........(((((.((((.(......).))))-).))))..(((((((....(((((((.....))))))).)))))))...(((((((.........((((..((((..(((((((((....))).))))))..))))..))))..)))))))......((...(.....((((((......)))))).)..))---
CBCs: __________________(__________)_________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ___________________________________________________________________________________________________________(_____________________________)_____________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 83.333
II: 100
III: 100
IV: 75
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 400
End: 594
|
