GI |
3688519  |
Accession |
AJ006667 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Coriolaceae ; Postia ; Postia sericeomollis
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Sequence |
ATGGAATCATCAACTCTTTTCCTTCTTTGTTGAAGGGATTGAGCTTGGACTTGGAGGTTTTATGCCGGCCTTTGTGGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGAACCTTTGCTGCATCAGCTGTTCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTCACTGTGAAGCATTACATTTTTGTGGGGTTCAGCTTCTAACCGTCCTGTTGAAGGAGGACATCATAATTGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-27.8 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTT--ATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCT---TGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGG-ATCGGCTTGTCGGTGTGATAA-TGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG---------TGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAG--AGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((..--..)))))))))))).))))).))(((((..---.(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((..-..(((.(((.(((((((((..-.))).))))))))))))....)))---------.....))))))))).......(((((......)--)))).................. Query: ATGGAATCATCAACTCTTTTCCTTCTTTGTTGAAGGGATTGAGCTTGGACTTGGAGGTTTTATGCCGG--CCTTTGTGGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGAACCTTTGCTGCATCAGCTGTTCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTCACTGTGAAGCATTACATTTTTGTGGGGTTCAGCTTCTAACCGTCCTGTTGAAGGAGGACATCATAATTGACCTCTGA ....((...(((((((..(((((((......)))))))..))).))))..))(((((......(((((--(((....)))))))).)))))..........((((.(...((.(((.....(((.((..(((((((((....))).)))))).)))))....)))..............)).).)))).......(((((......)..)))).................. CBCs: ______________((__(((______________)))__))________________________________________________________________________________(___(__________________________)__)_________________________________________(__________)_____________________ HCBCs: _____________(________((________))________)_____________________(_______(____)_____)______________________(____(_(__________________________________________________)______________)__)________________(______)________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 84.211 II: 100 III: 88.889 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 400
End: 628 |