GI |
3688531  |
Accession |
AJ006670 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Spongipellis ; Spongipellis delectans
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Sequence |
ATGGTATTCTCAATACCCCAAGTCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGATTTGGAGGTTTATGCTGGCGTTTGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCAAAGATGTTACTGCTACTCTTCAGCGTGATAATTGTCTACGCTGCCGTTGTACGGTATAAATAAGTCTCTGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATTTCTTGACATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-32 kcal/mol |
Model |
57116622 |
Alignment |
Sbjct: ATGGTATTCTCAATACCCTAAATCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGACTTGGAGGTTTTTCTTTGCTGGCTTCATTGTCGGCTCCTCTGAAATACATTAGTGCAGATATTGCTGTTACTCTTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGCAGATGTATGGCGAATTGAAGTCTGTGCTTCTAATCGTCTTTGGACAATTT-TTGAAATTCGA .......(((..(((((((..((((....)))).)))))))...))).(((((((.........((((((......)))))).)))))))........(((((((((.(((((((...(((.(((((((((....))).)))))).)))...)))))))......)))))))))((.(((.(((....))).))).-..))....... Query: ATGGTATTCTCAATACCCCAAGTCTTTGCGGATGAGGGTGTATTGGATTTGGAGGTT----TATGCTGGCGT--TTGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCAAAGATGTTACTGCTACTCTTCAGCGTGATAATTGTCTACGCTGCCGTTGTACGGTATAAATAAGTCTCTGCTTCTAATCGTCTTCGGACAATTTCTTGACATCTGA .......(((..((((((...((((....))))..))))))...))).(.(((((..----...((((((..--..)))))).))))).)........((((.((((..(((((.....(..(((((((((....))).))))))..).....))))).......)))).))))((.(((.(((....))).)))....))....... CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________(_____________________________________________)___________________________________________________ HCBCs: _____________________(__________)___________________________________________________________________((_______(___(___________(_______________)___________)___)____________))____________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 92.308 III: 82.143 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetes incertae sedis

Polyporales

Coriolaceae

Cerrena

Cerrena consors

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| unclassified Coriolaceae

Coriolaceae sp. TM06

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 398
End: 599 |