GI |
3688532  |
Accession |
AJ006677 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Skeletocutis ; Skeletocutis amorpha
|
Sequence |
ATTGTATTCTCAAACCCACCCCTCGCTTTTCGTGAGTGCGGTCGGGTTTGGATTTGGAGGTTTTTGCGGTTTTTCAAATTGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTGGAACCTTTGGACCGGCCTTCGGTGTGATAACTATCTACGCCGTGGTCACCGGGTGTCGAGGATCTGCTTATAATTGTCTCCGGACAAACTTTTCTGACATCT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-16.81 kcal/mol |
Model |
116248607 |
Alignment |
Sbjct: ATTAAATTCTC-AACCTATC---AGCTTTTCACAAAGCTCGGTATGGCTTGGATGTGGAGGTTTGCAGGTTTCTAACGAAGTCAGCTCCTCTGAAATGCATTAGTGGTACCCGTGCGGAACCGTCTATTGGTGTGATAA-TATCTACGCCGTGGACATCTGCTTTAAATGGGTTATGCTGCTTATAACCGTCCCTCTGTGGACAACTTATGACAAT- .........((-((((((((---((((((....)))))).)))).)).))))....(((((...((.((((((....)))))).)).))))).......((.(((((((((((((((((...((((((.((((((((..-.))).))))))))))).))))).....))))))...)))))).))....((((......)))).............- Query: ATTGTATTCTCAAACCCACCCCTCGCTTTTCGT-GAGTGCGGTCGGGTTTGGATTTGGAGGTTTTTGCGGTTTT-TCAAATT--GCTCCTCTTGAATGCATTAGCTGGAACCTT--TGGACCGGCCTTCGGTGTGATAACTATCTACGCCGTGGTCACCGGGTGTCGA-GGAT----CTGCTTATAATTGTCTCCGGACAAAC-TTTTCTGACATCT .........((.((((.(((...(((((.....-))))).)))..)).))))....(((((....(..(((((.-..)))))--)..))))).......((.(((.(.(.((.(--(((...((((.(.((((((((....))).)))))).)))).))).......)-)).)----).))).))....((.(......).))-............. CBCs: _______________________(______________)______________________________(__(____)__)___________________________________(_(____(______________________________)__)_)________________________________(______)_________________ HCBCs: __________________(_____(__(______)__)___)_______________________(__________________)___________________(____________________(__________________________)__________________________)_____________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 87.5 II: 84.615 III: 78.788 IV: 75 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 435
End: 639 |